Programinės įrangos projektai
Šiame puslapyje išvardyti įvairūs programinės įrangos projektais, kad aš rengiau. Dėl kodo eilutes atspindi, kiek esu parašęs ir apytiksliai, nes dauguma šių projektų yra nuolat modifikuotų vienokia ar kitokia forma.
| Projekto pavadinimas | Susijusios nuorodos | Programavimo kalbos | Kodo eilutes | Projekto aprašymas |
| Masės spektrometrija I / O, projekto (MSIOP) | IBG puslapis | C | 4500 | Dėl masės spektrometrija, I / O, projekto (MSIOP) yra masių spektrometrijos duomenų analizės ir saugojimo infrastruktūra. Ji apima moduliai įvesties ir išvesties duomenų, masės spektrometrija, kad ir iš įvairių gamintojas formatus, pvz. DTA, taip pat atidaryti ir XML paremtos mzXML formatas. Į MSIOP šiuo metu naudojami kaip pagrindas analizės priemones, tokias kaip spektrinės palyginimas, taip pat kitų bioinformatikos / masių spektrometrijos įrankių, naudojamų su Ilinojaus Biogrid ir bendradarbius. |
| Spektriniai palyginimas | Plakatas | C | 240 | Spektriniai palyginimas yra pastatyta ant MSIOP sistemą (žr. aukščiau) ir yra naudojama nustatant panašumą dviejų masių spektras. Spektriniai palyginimas naudoja kosinusas panašumas, be kitų metodų, kartu su kintama dėžutės dydį (žr. plakatas arba popieriuje). Kadangi masių spektrometrijos taikymas ir bioinformatikos dažnai procesoriaus ribotas, spektrinės palyginimas buvo parengtas atsižvelgiant į tai, ir turi atliekama iš O (n). |
